Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Notch2O35516 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Notch2O35516 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Notch2O35516 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch2O35516 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Notch2O35516 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms