Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms