Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn1O35350 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn1O35350 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn1O35350 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms