Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna3O35344 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna3O35344 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna3O35344 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna3O35344 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna3O35344 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna3O35344 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kpna3O35344 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpna3O35344 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpna3O35344 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms