Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pkd2O35245 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkd2O35245 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms