Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Polr1aO35134 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Polr1aO35134 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms