Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scarb2O35114 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scarb2O35114 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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