Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3cO35066 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3cO35066 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kif3cO35066 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kif3cO35066 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms