Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap23O09044 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snap23O09044 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snap23O09044 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap23O09044 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snap23O09044 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms