Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tcof1O08784 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms