Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3aO08759 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3aO08759 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3aO08759 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3aO08759 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3aO08759 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3aO08759 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3aO08759 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3aO08759 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3aO08759 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3aO08759 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3aO08759 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3aO08759 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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