Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp12O08736 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp12O08736 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms