Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltaO08585 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CltaO08585 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltaO08585 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltaO08585 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CltaO08585 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltaO08585 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltaO08585 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltaO08585 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltaO08585 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltaO08585 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltaO08585 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltaO08585 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltaO08585 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltaO08585 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltaO08585 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltaO08585 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltaO08585 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltaO08585 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltaO08585 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltaO08585 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltaO08585 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltaO08585 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltaO08585 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltaO08585 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltaO08585 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltaO08585 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CltaO08585 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CltaO08585 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CltaO08585 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltaO08585 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltaO08585 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltaO08585 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltaO08585 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltaO08585 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltaO08585 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltaO08585 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltaO08585 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltaO08585 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltaO08585 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltaO08585 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltaO08585 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltaO08585 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CltaO08585 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms