Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mesp2O08574 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms