Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna5O08543 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna5O08543 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms