Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp35M0QWN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Usp35M0QWN7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp35M0QWN7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp35M0QWN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp35M0QWN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp35M0QWN7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp35M0QWN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Usp35M0QWN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp35M0QWN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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