Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8906L7N2A2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8906L7N2A2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms