Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20939L7N243 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20939L7N243 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms