Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa3bJ9JI28 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vwa3bJ9JI28 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms