Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc191J3QQ27 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc191J3QQ27 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms