Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccer2J3QPU5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms