Protein–RNA interactions for Protein: J3QPK8

Gm21118, Predicted gene, 21118, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21118J3QPK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21118J3QPK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21118J3QPK8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms