Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms