Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp870J3QMA4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp870J3QMA4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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