Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20830J3KML6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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