Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm29394H3BIW7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm29394H3BIW7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms