Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf4bG5E8Z2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf4bG5E8Z2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf4bG5E8Z2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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