Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubgcp6G5E8P0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubgcp6G5E8P0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms