Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r67G5E8C1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r67G5E8C1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r67G5E8C1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms