Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933406M09RikG3XA12 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4933406M09RikG3XA12 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms