Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hmgxb3G3X9M3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hmgxb3G3X9M3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms