Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3tc1G3X9F6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3tc1G3X9F6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms