Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chrna9G3X8Z7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms