Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim15G3UY57 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms