Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8909G3UXE9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8909G3UXE9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms