Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx1-1G3UXB3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx1-1G3UXB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms