Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl26F8VQM2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl26F8VQM2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms