Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Farp1F8VPU2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Farp1F8VPU2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms