Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3443F7CCV5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3443F7CCV5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3443F7CCV5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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