Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17654F7AXR3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17654F7AXR3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms