Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
D430041D05RikF6ZGR6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
D430041D05RikF6ZGR6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
D430041D05RikF6ZGR6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms