Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Crocc2F6XLV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Crocc2F6XLV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Crocc2F6XLV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Crocc2F6XLV1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms