Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf212F6TQD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms