Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prl3d2F6R3P9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prl3d2F6R3P9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prl3d2F6R3P9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms