Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa35E9QLQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Defa35E9QLQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa35E9QLQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms