Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcmdc2E9Q956 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mcmdc2E9Q956 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcmdc2E9Q956 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms