Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A430078G23RikE9Q7Y4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms