Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm8882E9Q7E4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8882E9Q7E4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8882E9Q7E4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms