Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ythdc1E9Q5K9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc1E9Q5K9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc1E9Q5K9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc1E9Q5K9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms