Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ApobE9Q414 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ApobE9Q414 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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